Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbiaQ9Z1E3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms