Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z109

Vsig2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig2Q9Z109 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig2Q9Z109 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig2Q9Z109 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms