Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hmg20bQ9Z104 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms