Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn9Q9Z0S7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn9Q9Z0S7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn9Q9Z0S7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn9Q9Z0S7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn9Q9Z0S7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn9Q9Z0S7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn9Q9Z0S7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn9Q9Z0S7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn9Q9Z0S7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms