Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn10Q9Z0S6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn10Q9Z0S6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn10Q9Z0S6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn10Q9Z0S6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn10Q9Z0S6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn10Q9Z0S6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn10Q9Z0S6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn10Q9Z0S6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn10Q9Z0S6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms