Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AireQ9Z0E3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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