Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap4s1Q9WVL1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap4s1Q9WVL1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms