Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms