Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lemd3Q9WU40 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms