Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MthfrQ9WU20 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MthfrQ9WU20 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms