Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkraQ9WTX2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms