Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ggps1Q9WTN0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms