Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpc2Q9R244 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc2Q9R244 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms