Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms