Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms