Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ntn3Q9R1A3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ntn3Q9R1A3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ntn3Q9R1A3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ntn3Q9R1A3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ntn3Q9R1A3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ntn3Q9R1A3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ntn3Q9R1A3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms