Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms