Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Plod1Q9R0E2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms