Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmlQ9QZD5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmlQ9QZD5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms