Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC3

Bhlha15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha15Q9QYC3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlha15Q9QYC3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha15Q9QYC3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms