Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hacd1Q9QY80 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd1Q9QY80 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms