Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms