Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad18Q9QXK2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad18Q9QXK2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms