Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms