Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms