Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms