Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chaf1aQ9QWF0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1aQ9QWF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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