Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms