Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln8Q9QUK3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms