Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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