Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst11Q9JME2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst11Q9JME2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst11Q9JME2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst11Q9JME2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst11Q9JME2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst11Q9JME2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chst11Q9JME2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms