Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms