Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Higd1aQ9JLR9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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