Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Nectin3Q9JLB9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Nectin3Q9JLB9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin3Q9JLB9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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