Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms