Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arl6ip1Q9JKW0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms