Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmx1aQ9JKU8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms