Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx5Q9JKQ4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms