Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrQ9JKK8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms