Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms