Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nectin1Q9JKF6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nectin1Q9JKF6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nectin1Q9JKF6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nectin1Q9JKF6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nectin1Q9JKF6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nectin1Q9JKF6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nectin1Q9JKF6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nectin1Q9JKF6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nectin1Q9JKF6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin1Q9JKF6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms