Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms