Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ybx3Q9JKB3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ybx3Q9JKB3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms