Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms