Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip1Q9JJ57 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms