Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl11Q9JHH5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl11Q9JHH5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms