Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timp4Q9JHB3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp4Q9JHB3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms