Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Usp29Q9ES63 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Usp29Q9ES63 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Usp29Q9ES63 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Usp29Q9ES63 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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