Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3bQ9ES34 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms