Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trhr2Q9ERT2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trhr2Q9ERT2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trhr2Q9ERT2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trhr2Q9ERT2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trhr2Q9ERT2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trhr2Q9ERT2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trhr2Q9ERT2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trhr2Q9ERT2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trhr2Q9ERT2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trhr2Q9ERT2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms